Česká republika platí Evropské unii pokutu 810 milionů korun. Tu auditoři EU vyměřili na základě kontroly, kterou provedli v tuzemských chovech. Kontroly v menších i větších chovech dokázaly, že část chovaných krav je bez označení. Podle kontroly tak vyvstalo podezření, že některé společnosti mohou podvádět. V žádostech o dotace vykazují větší stádo, než reálně mají. Před kontrolou potom narychlo přesunují dobytek z jiných farem. Tyto krávy-cestovatelky přitom logicky nemohou mít označení, podle toho by bylo jasné, že jsou evidované na jiné farmě.
Kontroly podle serveru Echo24 provedla EU v roce 2015, následně úředníci rozhodli udělit pokutu celé ČR za to, že čeští úředníci chovy nekontrolují, a někteří velkozemědělci tak mohou podvádět. Pokutu 810 milionů ČR platí postupně, letos v srpnu odešle dalších zhruba 250 milionů. Hlavním otazníkem je, jaké farmy se podvodu dopustily. Vzhledem k tomu, že úředníci šli i po největších chovech, je téměř jisté, že navštívili i největšího zemědělce v zemi Andreje Babiše. Že auditoři kontrolovali i Agrofert, který v roce 2015 vlastnil jen Babiš, naznačil i ministr zemědělství Marian Jurečka. „Já to vyloučit nemohu. Ale jestli chcete být opravdu korektní, tak je to napříč zemědělským spektrem,“ řekl na dotaz Echo24.
Mluvčí Agrofertu Karel Hanzelka ve středu zveřejnil stanovisko svého zaměstnavatele k této kauze. To je však nejednoznačné. Neříká, zda u nich kontroloři byli a co zjistili, nebo zda v Babišových podnicích kontrola nebyla. „O auditu máme informace pouze z médií, takže jeho závěry nemůžeme nijak komentovat. Pokud je nám známo, audit a jeho vyřešení je zjevně věcí Ministerstva zemědělství ČR. Nerozumím tomu, proč s tím spojujete koncern AGROFERT. Dle našich informací se celá situace týká rozdílu v unijní a české legislativě z roku 2012 (zatímco EU požadovala hlášení zvířat do 7 dnů, tak česká legislativa měla lhůtu 15denní). S AGROFERTem to tedy nemá nic společného. Hlášení zvířat v podnicích koncernu AGROFERT patří ke standardním úkonům, které ukládají předpisy.“
Zdá se, že zemědělské podniky dotace získaly, nevrátí ani korunu a za to, že zřejmě podváděly, budou platit daňoví poplatníci.
V době, kdy mělo k podvodu dojít, patřil Agrofert Babišovi, ten byl současně také ministrem financí a místopředsedou vlády.
Není to zdaleka jediný případ, kdy bude stát muset platit za Agrofert. Další pokuta bude ve výši 22 milionů má být za to, že pravá ruka Andreje Babiše Jaroslav Faltýnek byl ve vedení Agrofertu a současně měl jako politik vliv na rozdělování dotací. Mohl mít vliv na to, že Agrofert získal dotace ve výši 1,5 miliardy.
Stále nedošetřené je také podezření na dotační podvod spojený s Čapím hnízdem, kde se za několik dní Babiš ožení. Na stavbu rezidence měl podvodně získat dotaci EU.